Kisah angsuran yang akan datang terjadi di tengah-tengah tanda-tanda rekonstruksi pascaperang di musim dingin 2028. Ketegangan meningkat di New Port City ketika demonstrasi diadakan mengenai kepentingan kartel asing. Ini mengarah pada insiden penembakan yang melibatkan polisi anti huru hara. Semuanya dimulai dengan infeksi otak cyber yang dirilis oleh teroris “Fire Starter.” Unit ofensif independen yang dipimpin oleh Makoto Kusanagi mempercayakan penindasan situasi kepada hantu-hantu mereka dan bertujuan untuk keadilan mereka sendiri. Di bawah permukaan insiden, terletak “gadis timah” Emma dan “orang-orangan sawah” Burinda Junior. Saat Kusanagi menangani insiden itu, dia mendekati apa yang dicari kedua hantu itu.