Tahun 2015 Masehi. Era terakhir di mana magecraft masih berkembang. Organisasi Keamanan Chaldea didirikan untuk fokus pada pelestarian kelanjutan sejarah manusia. Mereka mengamati dunia yang tidak bisa diamati oleh ilmu magis dan sains tidak bisa mengukur semuanya untuk mencegah kepunahan umat manusia. Tapi suatu hari, masa depan yang terus diamati oleh Chaldea menghilang dan kepunahan umat manusia pada 2017 menjadi jelas. Sebaliknya, itu sudah terjadi. Penyebabnya tampaknya terkait dengan Fuyuki, sebuah kota provinsi di Jepang, pada tahun 2004 Masehi. Di sana, “wilayah yang tidak dapat diobservasi” yang belum ada sebelumnya muncul. Berdasarkan asumsi bahwa Fuyuki adalah alasan kepunahan umat manusia, Chaldea mengeluarkan perintah untuk mengeksplorasi, menyelidiki, dan mungkin menghancurkan singularitas ini – sebuah pencarian Holy Grail, Grand Order.